A 蕨类植物
共有2种，均为二级。
石杉科Huperziaceae
1．长柄石杉Huperzia javanica，二级。
2．闽浙马尾杉Phlegmariurus mingchegensis，二级。
B 裸子植物
共有4种，其中一级1种、二级3种。
红豆杉科 Taxaceae
1．南方红豆杉Taxus mairei，一级。
2．榧树Torreya grandis，二级。
3．大盘山榧Torreya dapanshanica，二级。
C 被子植物
共有20种，均为二级。
I. 双子叶植物
共有13种，均为二级。
一、莼菜科 Cabombaceae
莼菜Brasenia schreberi，二级。
二、毛茛科 Ranunculaceae
短萼黄连Coptis chinensis var. brevisepala，二级。
三、小檗科 Berberidaceae
六角莲Dysosma pleiantha，二级。
四、榆科 Ulmaceae
1．长序榆Ulmus elongata，二级。
2．榉树（大叶榉）Zelkova schneideriana，二级。
五、桦木科Betulaceae
天台鹅耳枥Carpinus tientaiensis，二级。
六、蓼科 Polygonaceae
金荞麦Fagopyrum dibotrys，二级。
七、猕猴桃科Actinidiaceae
1．大籽猕猴桃Actinidia macrosperma，二级。
2．中华猕猴桃Actinidia chinensis，二级。
八、杜鹃花科 Ericaceae
华顶杜鹃Rhododendron huadingense，二级。
九、蝶形花科Fabaceae
野大豆Glycine soja，二级。
十、茜草科 Rubiaceae
香果树Emmenopterys henryi，二级。
十一、忍冬科 Caprifoliaceae
浙江七子花（七子花）Heptacodium miconioides subsp. jasminoides，二级。
II. 单子叶植物
共有8种，均为二级。
一、百合科Liliaceae
1．华重楼Paris polyphylla var. chinensis，二级。
2．狭叶重楼Paris polyphylla var. stenophylla，二级。
3．荞麦叶大百合Cardiocrinum cathayanum，二级。
二、兰科Orchidaceae
1．白及Bletilla striata，二级。
2．春兰Cymbidium goeringii，二级。
3．蕙兰Cymbidium faberi，二级。
4．细茎石斛Dendrobium moniliforme，二级。
5．台湾独蒜兰Pleione formosana，二级。